Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxw18Q3TSA9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms