Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2f1Q3THK3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms