Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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