Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riiad1Q3KNY5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms