Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdgfl1Q2VPR5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms