Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpm1Q2TV84 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms