Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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Shroom4Q1W617 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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Shroom4Q1W617 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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