Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Rpusd2Q149F1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd2Q149F1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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