Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc162pQ0VG85 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms