Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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