Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd2Q0VET5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd2Q0VET5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms