Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne7Q0VE82 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms