Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd12Q0VE29 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd12Q0VE29 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms