Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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Cntnap5cQ0V8T7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5cQ0V8T7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms