Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms