Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ubxn2bQ0KL01 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn2bQ0KL01 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms