Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kndc1Q0KK55 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms