Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms