Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnma1Q08460 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms