Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CbfbQ08024 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms