Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MestQ07646 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms