Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col17a1Q07563 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col17a1Q07563 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms