Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AmbpQ07456 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AmbpQ07456 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms