Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a1Q05722 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms