Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms