Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CkbQ04447 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CkbQ04447 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms