Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nucb1Q02819 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nucb1Q02819 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms