Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb4Q02738 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb4Q02738 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms