Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snai1Q02085 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snai1Q02085 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms