Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uba1Q02053 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uba1Q02053 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms