Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms