Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gja5Q01231 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja5Q01231 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms