Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2bQ01097 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grin2bQ01097 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms