Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms