Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfcP97953 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfcP97953 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms