Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prop1P97458 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Prop1P97458 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Prop1P97458 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Prop1P97458 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Prop1P97458 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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