Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms