Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms