Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms