Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TgfbiP82198 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TgfbiP82198 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfbiP82198 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms