Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx3P81067 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms