Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UrodP70697 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UrodP70697 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UrodP70697 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UrodP70697 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UrodP70697 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UrodP70697 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UrodP70697 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UrodP70697 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UrodP70697 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms