Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx3P70354 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms