Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad1P70340 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms