Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms