Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfixP70257 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfixP70257 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfixP70257 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfixP70257 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfixP70257 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfixP70257 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms