Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms