Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbdsP70122 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms