Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtnP63089 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtnP63089 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtnP63089 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtnP63089 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtnP63089 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtnP63089 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtnP63089 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtnP63089 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtnP63089 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtnP63089 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtnP63089 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms