Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms